通常版コミック(クリアカード編)

第1巻 †

• KCDX4199 ISBN978-4-06-393099-3
• なかよし2016年７月号-2016年10月号掲載分
• 第1刷 2016年12月2日
• 第2刷 2016年12月20日
• 第3刷 2016年12月27日
• 夢の鍵と透明なカードに導かれさくらの新しい物語がはじまる！　　桜満開の４月、中学１年生になったさくら。大好きな小狼と再開し、いっしょに学校へ通えることになって笑顔がはじけます！しかし不思議な夢をみて目覚めると、さくらのカードに異変が…？世界が待ってた新章「クリアカード編」、ついに開幕!!

• 初登場のカード
  • GALE
  • SIEGE
• 特装版
  • カードキャプターさくら 特製まんが家セット付きの特装版も発売された。ISBN978-4-06-358844-6
    コミック本体に関してはカバー背表紙の本来KCDXナンバーが書かれている部分が特装版表記になっている以外は同じである。

第2巻 †

• KCDX4271 ISBN978-4-06-393171
• なかよし2016年11月号-2017年2,4月号掲載分
• 第1刷 2017年4月1日
• あらたなカードと深まる謎…！世界が待ってた新章「クリアカード編」第2巻！　　夢で見た透明なカードによって、再び友枝町で起こりはじめた不思議な出来事たち。さくらは夢の中で出逢った『鍵』で、次々とあらたなカードを手に入れていきます！そんな中、さくらのクラスに女の子が転校してきて…！？

• 初登場のカード
  • AQUA
  • REFLECT
  • ACTION
• 特装版
  • オリジナルグッズ付き特装版も発売された。(ISBN978-4-06-358849)
    書き下ろし絵柄のアクキー、缶バッジ4個、ポストカードが付属する。

第3巻 †

• KCDX ISBN978-4-06-397038-8